Ursprünglich wurden die Effektiven Mikroorganismen als Bodenhilfsstoff entwickelt. Die Idee war es Dünger und Pflanzenschutzmittel zu sparen. Das Bodenleben wird angeregt. Im Rückblick ist es nicht verwunderlich dass diese Entdeckung aus Japan kommt, denn dort wird traditionell viel mit Fermentation gearbeitet und was kompostieren angeht sind Japaner echte Fanatiker.

Mit EM wird organische Substanz im Boden nicht so schnell abgebaut (fermentativer Umbau und Synthese statt Oxidation) und es entstehen viele für die Pflanze wertvolle Substanzen.  Durch die Vermeidung von Oxidation speichern die geimpften Böden mehr Energie und Humus. Die Unterdrückung von Fäulnis erspart den Pflanzen viele Giftstoffe.  Der Boden kann wieder seine natürliche Puffer- und Schutzfunktion ausüben.

Die Pflanzen danken einen EM-optimierten Boden mit besserem Wachstum der Feinwurzeln und weniger Anfälligkeit gegenüber Schädlingen und Krankheiten. Die Pflanzen können Nährstoffe besser ausnutzen – und dadurch wird deutlich weniger Dünger benötigt, ohne dass der Ertrag darunter leiden würde. Langfristig kann man ganz auf Mineraldünger verzichten. Die Qualität der Produkte wird besser, denn die Pflanzen enthalten mehr Antioxidantien und Vitamine (messbar als Redoxpotential) und halten sich dadurch länger.